El hacinamiento provocado por la cría intensiva de animales trae aparejado una gran cantidad de problemas (fundamentalmente desechos) que afectan la calidad de vida de los mismos animales. Las excretas se pueden compostar con bioaumentación. El Biocompost resultante reemplaza a un costo menor la fertilización química, con resultados mejores para el desarrollo vegetal. Los efluentes líquidos pueden ser tratados desde su origen, por ejemplo desde los slacks en la engorda de cerdos, reduciendo el amoníaco y predigiriendo el residuo antes de su entrada en la planta de tratamiento o lagunas de oxidación.